Em situações que um intervalo contínuo da sequência de numeração das suas notas é pulado você pode inutilizar todas desta sequencia de uma só vez.

Para isso basta acessar o Menu Emitir NF-e > Mais Ações > Inutilizar > Inutilizar várias Notas

Indique a primeira nota da sequência que deseja inutilizar, a última e a série das mesmas. Informe uma justificativa (Exemplo: Numeração pulada por erro de digitação) e depois clique em inutilizar no topo esquerdo da janela

Feito isso tudo certo, basta aguardar que todas as notas na sequência informada serão criadas e inutilizas e constaram no menu em que fez o procedimento.

Caso precise inutilizar uma nota ou mais que uma que foram puladas mas que não estão dentro de um mesmo intervalo você pode acessar Como inutilizar a numeração que foi pulada na NF-e.